www.2061.com

目的地区测序
 

对目的地区序列捕捉、富集后停止高通量测序。

 
样本范例
DNA样品
 
样本总量
≥2 μg DNA
 
托付周期
30天(不含定制探针工夫,可加急)澳门金沙娱乐官网

服务引见

 

目的地区测序是指操纵特制的探针对客户感兴趣的卵白编码地区DNA或某段特定序列停止捕捉,富集后停止高通量测序的基因组阐发办法。该办法可以得到指定目的地区的遗传信息,极大地提高了基因组中特定目的地区的研讨服从,明显低落了研讨本钱。经由过程目的地区测序,能够对候选位点或候选基因停止考证,也能够进一步找到候选地区或候选基因内的易感位点,适用于候选基因联系关系阐发等研讨。

手艺流程

 

样本质检

文库制备

澳门金沙娱乐官网

上机测序

数据质控

数据阐发

澳门金沙娱乐官网

 

捕捉平台

Agilent/NimbleGen

测序平台/深度

HiSeq、PE150/200X或更高

信息阐发

 
1

根据尺度流程停止base calling、raw data数据收拾整顿及数据质量评价。

2

与数据库停止比对

3

检测SNP和InDel。

澳门金沙4166.Am
4

变异地点基因的功用正文和统计

5

家系阐发和疾病阐发。

www.2061.com
6

其他个性化阐发内容

使用实例

 

澳门金沙娱乐官网

Hao, J.-J., et al., Spatial intratumoral heterogeneity and temporal clonal evolution in esophageal squamous cell carcinoma. Nature Genetics, 2016.

食管鳞状细胞癌(ESCC)是最常见的恶性肿瘤之一,但其肿瘤内空间异质性(ITH)和克隆退化机制仍是未知的。研究人员对来自13例食管鳞状细胞癌样品中的51个肿瘤地区的多地区停止了全外显子测序,并从中拔取3例样品停止多地区全甲基化阐发。研讨发明,异质性体细胞突变(强ITH)到达了均匀35.8%,一半的驱动突变定位在肿瘤系统发育树分支上,包罗PIK3CA,NFE2L2和MTOR等。在比照研讨中,研究人员发明大部分截断驱动突变和克隆驱动突变呈现在抑癌基因上,包罗TP53、KMT2D和ZNF750等。风趣的是,种系表观遗传学体系树可以片面归纳综合体系退化树(phylogenetic trees)的拓扑构造,这表白遗传学改动与表观遗传学改动之间能够存在联系关系。该研究成果系统分析空间ITH与克隆退化机制,为进一步理解ESCC的肿瘤开展与历程供给了主要的份子根底。

1504345471129349.png

图1. 13例ESCC体细胞突变的ITH

1504345492947344.png

图2. ESCC肿瘤样本驱动基因的克隆形态

9927.com
马上征询或预定检测服务
请挑选
  • 受检者
  • 研究人员
  • 大夫
  • 其他

您能够拨打400-158-5999 热线联络我们,大概填写您的联系方式和存眷的成绩,我们会实时与您获得联络